患了性病淋巴肉芽肿后，主要表现为腹股沟淋巴结肿胀、化脓，发展至晚期，可以产生许多严重的并发症。其中以直肠狭窄最为多见，尤其是女性。假如病变发生在尿道，可伴发尿道狭窄；若发生在阴道，可造成阴道狭窄，还可发生阴道与直肠之间因穿孔而形成的通道（医学上叫瘘道）及外阴毁损等严重破坏性损害。缺损的生殖器还可发生癌变。性病淋巴肉芽肿并非一开始就出现这些严重的病变，在临床上，按疾病的发展过程可分为早期（感染、原发损害和皮肤损害）、二期（淋巴管播散、伴发全身症状）和三期（晚期）。